アクセスログのエクスポートはSharePointのパフォーマンスに影響がありますか？

SharePointのパフォーマンスに影響ありません。ただし、エクスポートするログ件数によって時間がかかるため、完了すると自動で指定したメールアドレスにメール通知する機能を用意しています。